در صورت رعایت نکردن شرایط بهداشتی و نگرفتن گواهینامه های لازم برای صادرات پسته رفسنجان به اروپا، مشکلات زیادی را به همراه می آورد.
اخذ مجوز برای صادرات پسته رفسنجان به جندین نقطه در جهان ضروری است ،که اتحادیه اروپا، استرلیا و کانادا از جمله این نقاط در دنیا بشمار می رود.
این مجوز ها شامل مسائل بهداشتی به ویژه باکتری زهرابه ای که منجر به افلاتوکسین می شود، می باشد، برای صادرات پسته رفسنجان به اروپا باید مقدار افلاتوکسین پسته زیر 10 باشد وگرنه اروپاییان پسته صادراتی را نتنها که مرجوع نمی کنند، بلکه آن را معدوم می سازند، که موجب فراهم شدن مشکلات فراوانی برای صادر کننده و همچنین برند پسته رفسنجان نیز می شود.